Изграђена на падинама брда, урбана структура овог града морала је да се прилагоди топографским аспектима терена, иако је покушавала да поштује ретикуларни облик попут шаховске табле.
Овај аспект му је на крају омогућио да расте на одмерен и складан начин, који је током векова сачувао свој првобитни карактер. Његов темељ настао је из потребе да заштити и заштити путнике који су транзитирали између Закатекаса и главног града тадашње краљевине Нове Шпаније, превозећи углавном минерале и који су били опкољени од домородачких номада државе Чичимека. Око 1542, Фраи Јуан де Сан Мигуел је у близини данашњег града основао град са именом Итзцуинапан, посветивши Архангела Сан Мигуела као свеца заштитника. То примитивно становништво имало је озбиљне проблеме са водоснабдевањем, поред непрекидних и насилних напада аутохтоних Чичимека из околних региона. Из тог разлога становници виле де Сан Мигуел преселили су насеље неколико километара на североисток; то је било место где ће 1555. године, на захтев вицекраља Дон Луиса де Веласка, вилу де Сан Мигуел ел Гранде основати дон Ангел де Виллафане. Заменик је такође захтевао да се тамо населе суседи Шпаније којима ће бити додељена земља и стока, док ће староседеоцима који су живели у њој бити опроштен данак и њима ће управљати њихови поглавари како би избегли будуће побуне.
Осмог марта 1826. године Државни конгрес га је претворио у град и променио име, које ће одсада бити Сан Мигуел де Алленде, у част славног побуњеника који је тамо рођен 1779. године.
Унутар ове атрактивне колонијалне слике смештено је неколико заиста изванредних палата тог доба. Међу најистакнутијим су Општинска палата, некадашња градска кућа саграђена 1736. године. Кућа у којој је рођен Игнацио Алленде, пример барокне архитектуре града, посебно на њеној фасади, а која је тренутно Регионални музеј. Цаса дел Маиоразго де ла Цанал, са прелепом неокласичном фасадом, крајем 18. века довршио је Јосе Мариано де ла Цанал и Хервас, старији човек, декан и краљевски заставник. Стара властелинарска кућа Дон Мануел Т. де ла Цанал, грађевина из 1735. године, која је обновљена према пројекту славног шпанског архитекте Дон Мануела Толсе 1809. године; Тренутно се у згради налази Институт Алленде и истиче ширину својих унутрашњих дворишта, прелепе капеле и изванредне аркаде. Кућа инквизитора, која је служила као резиденција повереника Свете канцеларије, а датира из 1780. Кућа Маркуес де Јарал де Беррио, изграђена крајем 18. века, и кућа грофова Лоја са елегантном фасадом.
Што се тиче верске архитектуре, град се такође може похвалити архитектонским благом од изузетне вредности, попут цркве и самостана Санто Доминго, трезвене зграде из 1737. године. Самостан Леал де ла Цонцепцион, који је тренутно Културни центар, То је изузетна грађевина због свог огромног дворишта; Саградио га је у 18. веку архитекта Францисцо Мартинез Гудлно.
Капела Санта Цруз дел Цхорро, једна од најстаријих; храм Трећег реда, који датира с почетка седамнаестог века. Прекрасан ансамбл храма и ораторија Сан Фелипе Нери, с почетка 18. века; црква има бујну барокну фасаду израђену у ружичастом каменолому и украшену снажним аутохтоним утицајем. Његова унутрашњост има разнолику и богату декорацију између намештаја, скулптура и слика вредних дивљења, поред сјајне капеле Санта Цаса де Лорето и њене Цамарин де ла Вирген, како изврсно уређене, тако и због преданости маркиза Мануела Томас де ла Канал. У близини ораторија налази се храм Госпе од Здравља, саграђен у 18. веку са удубљеном фасадом крунисаном великом шкољком.
Такође међу најатрактивнијим у граду је храм Сан Франциска, из 18. века, са прелепом фасадом Цхурригуерескуе, а позната парохија готово је симбол Сан Мигуела де Аллендеа; Иако је новија градња у неоготичком стилу саграђена на структури старог храма из 17. века, поштујући у потпуности његову унутрашњост и првобитни план.
У непосредној близини града налази се светилиште Атотонилцо, грађевина трених пропорција из 13. века која личи на тврђаву и у којој су сачуване вредне слике из истог века.
