Рођен у Озумби, држава Мексико, 1737. године, прихватио је религиозну каријеру и заређен за свештеника у доби од двадесет година.
Упркос својој филозофској обуци, од малих ногу се бави знањем и применом природних наука, физике, математике и астрономије. У новинама и часописима свог времена објављује вредна дела о научним темама. Стекао је међународну репутацију и именован је за одговарајућег партнера Паришке академије наука. Проводи већи део свог времена изводећи научне експерименте и окупља огромну библиотеку. Сакупљач је археолошких предмета и ретких примерака биљака и животиња. Истражите Ксоцхицалцо. Да би му се поклонили, 1884. године основано је Научно друштво Антонио Алзате, које је 1935. постало Национална академија наука. Његово најпознатије уредничко дело су белешке о древној историји Мексика језуита Франциска Хавијера Клавијера. Каже се да је далеки рођак Сор Јуане Инес де ла Цруз. Умро је у Мексико Ситију 1799.