Цолегио де Сан Јуан де Летран започео је тако што је себе назвао „Цолегио пара местизос“, а створен је 1548. године, на иницијативу полуострвних Шпанаца који су забележили пораст броја местиза рођених у Новој Шпанији којима је било потребно образовање.
Цолегио де Сан Јуан де Летран започео је тако што је себе назвао „Цолегио пара местизос“, а створен је 1548. године, на иницијативу шпанског полуострва, који је видео пораст броја рођених местиза у Новој Шпанији којима је било потребно образовање.
Да би основали ову институцију, нису тражили дозволу поткраља Антонија де Мендозе, већ су послали представника у Шпанију да добије краљево овлашћење, а за наведену мисију именован је Дон Грегорио де ла Пескуера. Ова одговорна особа добила је Краљевско уверење о овлашћењу издато 18. августа 1548. У својим почецима, Колеџ је добио игру од 600 хиљада пезоса од рударства, приватних прилога и милостиње.
Предводила су га три свештеника: ректор и два одборника, ректор је могао да издржи годину дана на свом месту, а затим би остала двојица могла да заузму жупни двор. Читали су хришћанску доктрину, а потом су се напреднији студенти подстицали да иду на колеџ.
Школа је пропала крајем 18. века, опстала је до независности и 1821. године добила је велико појачање, али је коначно нестала 1857. године. Налазила се на старој улици Сан Јуан де Летран између садашње улице Венустиано Царранза и Мадера на плочнику. била је окренута према истоку испред самостана у Сан Франциску који је заузимао целу улицу.
